Bệnh viện có nhiệm vụ chăm sóc sức khỏe ban đầu, khám bệnh điều trị cho cán bộ, công nhân viên chức ngành nông nghiệp và nhân dân địa phương, khám sức khỏe định kỳ cho cán bộ, nhân viên cơ quan Bộ, khám tuyển sinh cho các trường đại học, cao đẳng, trung học thuộc Bộ, khám sức khỏe cho chuyên gia và lao động xuất khẩu trong và ngoài ngành nông nghiệp.

 Bệnh viện có 300 cán bộ, nhân viên, 01 Phó giáo sư - Tiến sỹ, 02 người đang làm nghiên cứu sinh, 21 thạc sỹ,  6 chuyên khoa cấp  II, 26 chuyên khoa cấp I và 41 bác sỹ, dược sỹ, 136 điều dưỡng và nữ hộ sinh còn lại là các thành phần khác. Đội ngũ thầy thuốc của bệnh viện luôn nhiệt tình, có tinh thần trách nhiệm cao, hết lòng vì bệnh nhân, được người bệnh và nhân dân tin yêu.

Bệnh viện đầu tư trang bị nhiều máy móc hiện đại như: máy chụp cắt lớp, máy siêu âm màu 4D, máy tán sỏi, máy điều trị laser, máy nội soi ống mềm dạ dày tá tràng, đại tràng... Phẫu thuật nội soi tai mũi họng, nội soi ổ bụng, nội soi tiền liệt tuyến, tán sỏi ngược dòng, phẫu thuật phaco và khu chạy thận nhân tạo với 25 máy hoạt động 3 ca.

Năm 2011, Bệnh viện luôn hoàn thành xuất sắc vượt chỉ tiêu kế hoạch giường bệnh. Ngoài công tác khám bệnh điều trị nội trú, Bệnh viện còn là sơ sở thực tập cho sinh viên Đại học Y Hà Nội, Học viện quân y, Đại học LIEGUE (Bỉ), các trường cao đẳng, trung học y tế và dược của Hà Nội và các tỉnh Hải Dương, Vĩnh Phúc, Phú Thọ và một số đơn vị quân đội.

Trong năm qua, Bệnh viện Nông Nghiệp luôn nhận được sự quan tâm giúp đỡ của lãnh đạo Bộ nông nghiệp và PTNT, Bộ Y tế và các cơ quan chức năng. Đảng ủy, Ban giám đốc bệnh viện luôn có chủ trương, biện pháp chỉ đạo hoạt động cụ thể kịp thời, ưu tiên các trọng điểm chuyên môn. Nội bộ Bệnh viện đoàn kết nhất trí, triển khai thực hiện kế hoạch năng động, sáng tạo và đã nhận được sự tín nhiệm tin tưởng của cán bộ nhân viên trong ngành nông nghiệp và nhân dân khu vực phía Nam Hà Nội.

Năm 2011, Bệnh viện Nông nghiệp tiếp tục đạt danh hiệu bệnh viện xuất sắc toàn diện Bộ Y tế; Đơn vị đã có thành tích xuất sắc trong công tác và sản xuất kinh doanh dẫn đầu phong trào thi đua Bộ Nông nghiệp và PTNT. Đặc biệt, Bệnh viện Nông nghiệp được Chủ tịch nước tặng Huân chương Lao động hạng Nhì cho tập thể cán bộ, nhân viên bệnh viện. Đồng chí Hà Hữu Tùng - Giám đốc Bệnh viện được tặng thưởng Huân chương Lao động hạng Ba. Bệnh viện đã có 02 cá nhân (đồng chí Hà Hữu Tùng và đồng chí Nguyễn Duy Thắng) được Tổng Liên đoàn Lao động Việt Nam cấp bằng lao động sáng tạo và 51 cá nhân được Bộ trưởng Bộ y tế tặng kỷ niệm chương “Vì sức khoẻ nhân dân”.